Έως το 1930 ως πρωταθλητής σύλλογος ανακηρυσσόταν ο πολυνίκης, μετά υπήρξε βαθμολόγηση 3 / 6 / 8 / 12 πρώτων.
Απο το 1931 γινεται και πανελλήνιο πρωτάθλημα Γυναικών, αρχικά συνήθως χωριστά από των Ανδρών
Στο Παναθηναϊκό Στάδιο έγινε τελευταία φορά πανελλήνιο πρωτάθλημα το 1964. Από τότε μάλιστα γινεται πάντα μαζί η διοργάνωση Ανδρών-Γυναικών.
Το 1983 το Πανελλήνιο Πρωτάθλημα έγινε για πρώτη του φορά στο νεόδμητο τότε Ο.Α.Κ.Α.
Από το πρωτάθλημα του 1985 σταμάτησαν να βαθμολογούνται στο Πανελλήνιο Πρωτάθλημα οι Κυπριακοί σύλλογοι (Το 1983 είχε ιδρυθεί η ΚΟΕΑΣ).
Ορισμένα αγωνίσματα (Μαραθώνιος, 10.000μ., σύνθετα) συνήθως γίνονται σε άλλες ημερομηνίες και τοποθεσίες.
- 1896 Παναθηναικό Στ. – ΑΟ Αθηνών
- 1901 Παναθηναικό Στ. – Εθνικός ΓΣ [στίβος] , Πανελλήνιος [σύνολο αθλημάτων]
- 1904 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος
- 1905 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος
- 1906 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος
- 1907 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος
- 1908 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος
- 1909 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος
- 1910 Παναθηναικό Στ. – Εθνικός ΓΣ
- 1911 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος
- 1912 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος
- 1914 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος
- 1917 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος
- 1919 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος
- 1920 Παναθηναικό Στ. – Εθνικός ΓΣ
- 1924 Παναθηναικό Στ. – Παγκύπρια Λευκωσίας
- 1925 Λεμεσός – Εθνικός ΓΣ
- 1926 Παναθηναικό Στ. – Εθνικός ΓΣ
- 1927 Θεσ., γυμν. Ηρακλή – Εθνικός ΓΣ
- 1928 Παναθηναικό Στ. – Εθνικός ΓΣ
- 1930 Θεσ., γυμν. Ηρακλή – Εθνικός ΓΣ
- 1931 (Παναθ.Στ.) Εθνικός ΓΣ / (Παναθ.Στ.) ΑΟ Π.Φαλήρου
- 1932 (Παναθ.Στ.) ΑΟ Π.Φαλήρου / (Παναθ.Στ.) ΑΟ Π.Φαλήρου
- 1933 (Παναθ.Στ.) Πανελλήνιος / αναβλήθηκε
- 1934 Παναθηναικό Στ. – Πανελλήνιος / ΑΟ Π.Φαλήρου
- 1935 (Παναθ.Στ.) Πειραικός / (Παναθ.Στ.) ΑΟ Π.Φαλήρου
- 1936 (Παναθ.Στ.) Πανελλήνιος / (Παναθ.Στ.) ΑΟ Π.Φαλήρου
- 1937 (Παναθ.Στ.) Εθνικός ΓΣ / (Παναθ.Στ.) ΑΟ Π.Φαλήρου
- 1938 (Παναθ.Στ.) Εθνικός ΓΣ / (Παναθ.Στ.) Πανελλήνιος
- 1939 (Παναθ.Στ.) Εθνικός ΓΣ / (Παναθ.Στ.) Πανελλήνιος
- 1940 Παναθηναικό Στ. – Εθνικός ΓΣ / Πανελλήνιος
- 1946 Παναθηναικό Στ. – Εθνικός ΓΣ / Παναθηναικός
- 1947 Παναθηναικό Στ. – Εθνικός ΓΣ / Παναθηναικός
- 1948 Παναθηναικό Στ. – Εθνικός ΓΣ / ΑΟ Π.Φαλήρου
- 1949 (Παναθ.Στ.) Εθνικός ΓΣ / (Παναθ.Στ.) Παναθηναικός
- 1950 (Τρίκαλα) Εθνικός ΓΣ / (γυμν. Εθνικού) ΑΟ Κηφισιας
- 1951 (Παναθ.Στ.) Εθνικός ΓΣ / (γυμν. Εθνικού) Πανελλήνιος
- 1952 (Παναθ.Στ.) χωρίς βαθμολογηση / (Παναθ.Στ.) Πανελλήνιος
- 1953 (Αλεξανδρούπολη) Εθνικός ΓΣ / (Παναθ.Στ.) Πανιώνιος
- 1954 (Παναθ.Στ.) Εθνικός ΓΣ / (Παναθ.Στ.) Πανιώνιος
- 1955 (Παναθ.Στ.) Παναθηναικός / (γυμν. Εθνικού) Πανιώνιος
- 1956 (Παναθ.Στ.) Παναθηναικός / (γυμν. Εθνικού) Πανιώνιος
- 1957 (Παναθ.Στ.) Παναθηναικός / (γυμν. Εθνικού) Πανιώνιος
- 1958 (Παναθ.Στ.) Παναθηναικός / (γυμν. Εθνικού) Πανιώνιος
- 1959 (Παναθ.Στ.) Παναθηναικός / (Καβάλα) Πανιώνιος
- 1960 Παναθηναικό Στ. -> Παναθηναικός / Πανιώνιος
- 1961 (Παναθ.Στ.) Παναθηναικός / (Θεσ., Καυτανζ. Στ.) Πανιώνιος
- 1962 (Παναθ.Στ.) Παναθηναικός / (Παναθ.Στ.) Πανιώνιος
- 1963 (Παναθ.Στ.) Παναθηναικός / (Παναθ.Στ.) Πανιώνιος
- 1964 Παναθηναικό Στ. -> Παναθηναικός / Πανιώνιος
- 1965 Στ. Καραισκάκη -> Παναθηναικός / Πανιώνιος
- 1966 Στ. Καραισκάκη -> Παναθηναικός / Πανιώνιος
- 1967 Στ. Καραισκάκη -> Παναθηναικός / Πανιώνιος
- 1968 Θεσ., Καυτανζ. Στ. -> Παναθηναικός / Ολυμπια Λεμεσου
- 1969 Στ. Καραισκάκη -> Παναθηναικός / Πανιώνιος
- 1970 Στ. Καραισκάκη -> Παναθηναικός / Πανιώνιος
- 1971 Καβάλα -> Παναθηναικός / Πανιώνιος
- 1972 Στ. Καραισκάκη -> Παναθηναικός / Πανιώνιος
- 1973 Στ. Καραισκάκη -> Παναθηναικός / Πανιώνιος
- 1974 Στ. Καραισκάκη -> Παναθηναικός / Πανιώνιος
- 1975 Στ. Καραισκάκη -> Ηρακλής Θ. / Εθνικός ΓΣ
- 1976 Στ. Καραισκάκη -> Ηρακλής Θ. / ΠΑΟΚ
- 1977 Στ. Καραισκάκη -> Παναθηναικός / ΠΑΟΚ
- 1978 Στ. Καραισκάκη -> Πανελλήνιος / Πανιώνιος
- 1979 Θεσ., Καυτανζόγλειο -> Ηρακλής Θ. / Παγκυπρια Λευκωσιας
- 1980 Λευκωσία, Μακάρειο -> Ευαγόρας Αμμοχώστου / Παγκυπρια Λευκωσιας
- 1981 Στ. Καραισκάκη -> Πανελλήνιος / Παγκυπρια Λευκωσιας
- 1982 Χανιά -> Πανελλήνιος / ΠΑΟΚ
- 1983 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Ολυμπια Λεμεσου
- 1984 Θεσ., Καυτανζόγλειο -> Ηρακλής / Πανελλήνιος
- 1985 ΟΑΚΑ -> Ηρακλής / Πανελλήνιος
- 1986 ΟΑΚΑ -> Ηρακλής / Πανελλήνιος
- 1987 ΟΑΚΑ- Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 1988 Θεσ., Καυτανζόγλειο -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 1989 ΟΑΚΑ -> Παναθηναικός / Πανελλήνιος
- 1990 Τρίκαλα -> Παναθηναικός / Πανελλήνιος
- 1991 Φάληρο -> Πανελλήνιος / Ηρακλής Θ.
- 1992 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 1993 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 1994 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 1995 Πάτρα -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 1996 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 1997 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 1998 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 1999 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 2000 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 2001 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 2002 Τρίκαλα -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 2003 Τρίκαλα -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 2004 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 2005 ΟΑΚΑ -> Πανελλήνιος / Πανελλήνιος
- 2006 Τρίκαλα -> Ολυμπιακός / Πανελλήνιος
- 2007 ΟΑΚΑ -> Ολυμπιακός / Πανελλήνιος
- 2008 ΟΑΚΑ -> Ολυμπιακός / Πανελλήνιος
- 2009 Θεσ., Καυτανζόγλειο -> Ολυμπιακός / Πανελλήνιος
- 2010 Πάτρα -> Ολυμπιακός / Ολυμπιακός
- 2011 ΟΑΚΑ -> Ολυμπιακός / ΑΕΚ
- 2012 ΟΑΚΑ -> Ολυμπιακός / ΑΕΚ
- 2013 ΟΑΚΑ -> Ολυμπιακός / ΑΕΚ
- 2014 ΟΑΚΑ -> Ολυμπιακός / ΑΕΚ
- 2015 ΟΑΚΑ -> Ελ.Βενιζέλος Χ. / ΓΣ Γλυφάδας
- 2016 Πάτρα -> Ολυμπιακός / Ελ.Βενιζέλος Χ.
- 2017 Πάτρα -> Ολυμπιακός / ΓΣ Κηφισιας
- 2018 Πάτρα -> Ολυμπιακός / ΓΣ Γλυφάδας
- 2019 Πάτρα -> Ολυμπιακός / ΓΣ Κηφισιας
- 2020 Πάτρα -> Ολυμπιακός / ΓΣ Γλυφάδας
- 2021 Πάτρα -> Αλέξ.Μακεδονίας / ΓΣ Γλυφάδας
- 2022 Θεσ., Καυτανζόγλειο -> Ολυμπιακός / Αλέξ.Μακεδονίας
- 2023 Βόλος -> Ελ.Βενιζέλος Χ. / Αλέξ.Μακεδονίας
- 2024 Βόλος -> Ελ.Βενιζέλος Χ. / Αλέξ.Μακεδονίας
(Σημείωση: Ενδεχομένως τα τελευταία χρόνια, να έχει υπάρξει μεταβολή στους επικεφαλής της συνολικής βαθμολογίας, από αγωνίσματα που έγιναν μετά το κεντρικό πανελλήνιο πρωτάθλημα, ιδίως καθώς από το 2022 ο Μαραθώνιος εντάσσεται στο ημερολογιακό έτος)